重庆轨道交通27号线工程磁器口站位于童家桥正街与磁童路站交叉路口，沿童家桥正街南北向敷设，与地铁1号线磁器口站换乘，本站为地下两层双岛四线越行车站，标准段为双洞小净距双层大跨暗挖隧道，站前单渡线段采用暗挖拱形断面。车站外包总长726.3m，本站共设置2组风亭，4个出入口，6个安全出口及东、西侧换乘厅；其中风亭设置在车站标准段两端，均为正上方顶出风井，主体标准段左右线隧道间设置1#-8#横通道。